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Enregistrement W2156712047 · doi:10.1118/1.2936229

3T MRI evaluation of the accuracy of atlas-based subthalamic nucleus identification

2008· article· en· W2156712047 sur OpenAlexaboutno aff
Joseph Stancanello, Alexander Muacevic, Fabio Sebastiano, Nicola Modugno, Pietro Cerveri, Giancarlo Ferrigno, Fulvio Uggeri, Pantaleo Romanelli

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurological disorders and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubthalamic nucleusDeep brain stimulationAtlas (anatomy)Magnetic resonance imagingComputer scienceAffine transformationArtificial intelligenceNuclear medicineBrain atlasComputer visionPattern recognition (psychology)Parkinson's diseaseMedicineRadiologyMathematicsAnatomyPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modulation of the activity of the subthalamic nucleus (STN) using deep brain stimulation (DBS) in patients with advanced Parkinson's disease is the most common procedure performed today by functional neurosurgeons. The STN contours cannot be entirely identified on common 1.5 T images; in particular, the ventromedial border of the STN often blends with the substantia nigra. 3 T magnetic resonance imaging (MRI) provides better resolution and can improve the identification of the STN borders. In this work, we have directly identified the STN using 3 T MR imaging to validate the accuracy of a computer-aided atlas-based procedure for automatic STN identification. Coordinates of the STN were obtained from the Talairach and Tournoux atlas and transformed into the coordinates of the Montreal Neurological Institute (MNI) standard brain volume, creating a mask representation of the STN. 3 T volumetric T1 and T2 weighted (T1w and T2w, respectively) acquisitions were obtained for ten patients. The MNI standard brain volume was registered onto each patient MRI, using a new approach based on global affine, region-of-interest affine, and local nonrigid registrations. The estimated deformation field was then applied to the STN atlas-based mask, providing its location on the patient MRI. The entire procedure required on average about 20 min. Because STN is easily identifiable on 3 T T2w-MRIs, it was manually delineated; the coordinates of the center of mass of the manually and automatically identified structures were compared. Additionally, volumetric overlapping indices were calculated and the spatial relationship between the midcommissural point and the STN center of mass was investigated. All indices indicated, on average, good agreement between manually and automatically identified structures; displacement of the centers of mass of the manually and automatically identified structures was less than or equal to 2.35 mm, and more than 80% of the manually identified volume was covered by the automatic localization, on average. Bland-Altman analysis indicated that the automatic STN identification was within the limits of agreement with the manual localization on 3 T MRIs. Automatic atlas-based STN localization provides an accurate and user-friendly tool and can enhance target identification when 1.5 T scanners with limited capability to identify the STN boundaries are used.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,333
Score d'incertitude au seuil0,179

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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