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Enregistrement W2156745563 · doi:10.1186/1744-8069-6-11

Expression Genetics Identifies Spinal Mechanisms Supporting Formalin Late Phase Behaviors

2010· article· en· W2156745563 sur OpenAlexaff
Xiangqi Li, Peyman Sahbaie, Ming Zheng, Jennifer Ritchie, Gary Peltz, Jeffrey S. Mogil, J. David Clark

Notice bibliographique

RevueMolecular Pain · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePain Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésGeneticsNeuroscienceBiologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Formalin injection into rodent hind paws is one of the most commonly employed pain assays. The resulting nocifensive behaviors can be divided into two phases differing in timing, duration and underlying mechanisms. Spinal sensitization has long been felt to participate in the second phase of this response, although this sensitization is incompletely understood. By using correlative analysis between spinal gene expression and mouse strain-dependent intensity of late phase behavior, we hypothesized genes participating in variability of the response could be identified. RESULTS: Late phase formalin behavior scores among 10 inbred mouse strains were correlated with a spinal cord gene expression database constructed using expression arrays. Messenger RNA levels for several genes were highly correlated with the late phase behavioral responses. Most of these genes had already been implicated in mechanisms regulating pain and analgesia. One of the most strongly correlated genes, Mapk8 coding for c-Jun N-terminal kinase 1 (JNK1), was chosen for further analysis. Studies using additional strains of mice confirmed that spinal cord mRNA expression levels of Mapk8 followed the pattern predicted by strain-specific levels of formalin behavior. Interestingly, spinal cord JNK1 protein levels displayed an inverse relationship with mRNA measurements. Finally, intrathecal injections of the selective JNK inhibitor, SP600125, selectively reduced late phase licking behavior. CONCLUSIONS: Wide differences in pain behaviors, including those resulting from the injection of formalin, can be observed in inbred strains of mice suggesting strong genetic influences. Correlating levels of gene expression in tissues established to be mechanistically implicated in the expression of specific behaviors can identify genes involved in the behaviors of interest. Comparing formalin late phase behavior levels with spinal cord gene expression yielded several plausible gene candidates, including the Mapk8 gene. Additional molecular and pharmacologic evidence confirmed a functional role for this gene in supporting formalin late phase responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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