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Enregistrement W2156922297 · doi:10.1637/9608-120610-reg.1

Gene Expression Profiling in rMd5- and rMd5Δmeq-Infected Chickens

2011· article· en· W2156922297 sur OpenAlexaff
Ming Xu, Huanmin Zhang, Lucy Lee, Hongwei Gao, Shayan Sharif, Robert F. Silva, Mohammad Heidari

Notice bibliographique

RevueAvian Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMarek's diseaseGeneVirologyVirusGene expression profilingGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marek's disease (MD) is a lymphoproliferative disorder of domestic chickens caused by a highly contagious and oncogenic alpha-herpesvirus, Marek's disease virus (MDV). MD is characterized by bursal-thymic atrophy and rapid onset of T-cell lymphomas that infiltrate lymphoid tissues, visceral organs, and peripheral nerves with severe clinical signs that include transient paralysis, anemia, weight loss, and neurologic disorders. Using overlapping cosmids- and BAC-cloned MDV, it has been shown that MDV-encoded vIL-8, pp38, vTR, vLIP, RLORF4, and meq are among the many essential genes that play critical roles in viral pathogenesis. Of all the genes investigated so far, only meq has been shown to be consistently expressed in all MDV-derived tumors and lymphoblastoid cell lines. Meq is a basic leucine-zipper protein that shares homology with the jun/fos family of transcriptional factors. There are two copies of meq gene within the MDV genome that are only present in the serotype-1 strains. It has been shown conclusively that deletion of meq results in loss of transformation of T cells in chickens, with no effect on the early cytolytic phase of infection in lymphoid organs, which is essential for induction of innate and adaptive immunity. The goal of this study was to investigate 1) the effect of the meq oncogene on the expression pattern of select chicken immune and nonimmune-related genes, and 2) its potential role in MDV-induced apoptosis. We used real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction to evaluate the expression profiling of a panel of chicken genes in rMd5- and rMd5deltameq-infected chickens at 5, 14, 21, and 35 days postinfection (dpi). Although the transcriptional activities of several immune-related genes, including IL-6, IL-10, cMGF, GM-CSF, iNOS, IFNbeta, and INFgamma, were higher in rMd5deltameq-infected chickens at 5 dpi when compared to the rMd5-infected birds, the differences in expression levels of the tested genes between the two viral constructs were not significant. In addition, a reduction in the transcriptional activity of Bdcl2 in recombinant fowlpox virus (rFPV)+meq-infected chicken embryonic fibroblasts suggested that meq alone did not impede FPV-induced apoptosis. The likely suppressive nature and anti-inflammatory function of the meq oncogene and its possible role in virus-induced cell death is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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