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Enregistrement W2156943993 · doi:10.1093/genetics/162.4.1763

A Role for the Drosophila SU(VAR)3-9 Protein in Chromatin Organization at the Histone Gene Cluster and in Suppression of Position-Effect Variegation

2002· article· en· W2156943993 sur OpenAlexaff
Sarbjit S. Ner, Michael Harrington, Thomas A. Grigliatti

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHistone methyltransferaseGeneticsHeterochromatin protein 1Histone H1ChromatinHistone codeHistone methylationHistone H2APosition effectChromatin immunoprecipitationHistoneLocus (genetics)Histone H3HeterochromatinGene clusterMolecular biologyGeneNucleosomeGene expressionDNA methylationPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the gene for Su(var)3-9 are dominant suppressors of position-effect variegation (PEV). We show that SU(VAR)3-9 is a chromatin-associated protein and identify the large multicopy histone gene cluster (HIS-C) as one of its target loci. The organization of nucleosomes over the entire HIS-C region is altered in Su(var)3-9 mutants and there is a concomitant increase in expression of the histone genes. SU(VAR)3-9 is a histone H3 methyltransferase and, using chromatin immunoprecipitation, we show that SU(VAR)3-9 is present at the HIS-C locus and that the histone H3 at the HIS-C locus is methylated. We propose that SU(VAR)3-9 is involved in packaging HIS-C into a distinct chromatin domain that has some of the characteristics of beta-heterochromatin. We suggest that methylation of histone H3 is important for the chromatin structure at HIS-C. The chromosomal deficiency for the HIS-C is also a suppressor of PEV. In contrast to what might be expected, we show that hemizygosity for the HIS-C locus leads to a substantial increase in the histone transcripts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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