The lipid A palmitoyltransferase PagP: molecular mechanisms and role in bacterial pathogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Palmitoylated lipid A can both protect pathogenic bacteria from host immune defences and attenuate the activation of those same defences through the TLR4 signal transduction pathway. A palmitate chain from a phospholipid is incorporated into lipid A by an outer membrane enzyme PagP, which is an 8-stranded antiparallel beta-barrel preceded by an amino-terminal amphipathic alpha-helix. The PagP barrel axis is tilted by 25 degrees with respect to the membrane normal. An interior hydrophobic pocket in the outer leaflet-exposed half of the molecule functions as a hydrocarbon ruler that allows the enzyme to distinguish palmitate from other acyl chains found in phospholipids. Internalization of a phospholipid palmitoyl group within the barrel appears to occur by lateral diffusion from the outer leaflet through non-hydrogen-bonded regions between beta-strands. The MsbA-dependent trafficking of lipids from the inner membrane to the outer membrane outer leaflet is necessary for lipid A palmitoylation in vivo. The mechanisms by which bacteria regulate pagP gene expression strikingly reflect the corresponding pathogenic lifestyle of the bacterium. Variations on PagP structure and function can be illustrated with the known homologues from Gram-negative bacteria, which include pathogens of humans and other mammals in addition to pathogens of insects and plants. The PagP enzyme is potentially a target for the development of anti-infective agents, a probe of outer membrane lipid asymmetry, and a tool for the synthesis of lipid A-based vaccine adjuvants and endotoxin antagonists.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».