Genes similar to naphthalene dioxygenase genes in trifluralin‐degrading bacteria
Notice bibliographique
Résumé
Trifluralin (alpha,alpha,alpha-trifluoro-2,6-dinitro-N,N-dipropyl-p-toluidine) is a dinitroaniline compound which was first produced in the 1960s and has been used extensively as an agricultural herbicide. There are a few publications on the biodegradation of this xenobiotic compound, but to our knowledge nothing has been documented on the genetic aspects of its catabolism. In this article, we report the analysis of DNA isolated from bacteria previously shown to degrade trifluralin, using as probes the catabolic genes ndoB, todC, xyIX, catA and xyIE which encode the enzymes naphthalene 1,2-dioxygenase, toluene dioxygenase, toluate 1,2-dioxygenase, catechol 1,2-dioxygenase and catechol 2,3-dioxygenase respectively. Using PCR and hybridization analysis, the strong hybridization of the ndoB gene with DNA extracted from four trifluralin-degrading isolates was demonstrated, although none of them was able to degrade naphthalene, as indicated by the 'clear zone' test. The results indicated the presence in these bacteria of a dioxygenase gene, whose product could act on trifluralin as its principal substrate, or fortuitously, by cometabolism. This is the first publication on genes in trifluralin-degrading bacteria.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».