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Enregistrement W2157060317 · doi:10.1074/jbc.m109.019042

Red Fluorescent Protein pH Biosensor to Detect Concentrative Nucleoside Transport

2009· article· en· W2157060317 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San DiegoNational Cancer InstituteAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésFluorescenceChemistryNucleosideBiosensorFluorescent proteinBiochemistryChromatographyGreen fluorescent protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human concentrative nucleoside transporter, hCNT3, mediates Na+/nucleoside and H+/nucleoside co-transport. We describe a new approach to monitor H+/uridine co-transport in cultured mammalian cells, using a pH-sensitive monomeric red fluorescent protein variant, mNectarine, whose development and characterization are also reported here. A chimeric protein, mNectarine fused to the N terminus of hCNT3 (mNect.hCNT3), enabled measurement of pH at the intracellular surface of hCNT3. mNectarine fluorescence was monitored in HEK293 cells expressing mNect.hCNT3 or mNect.hCNT3-F563C, an inactive hCNT3 mutant. Free cytosolic mNect, mNect.hCNT3, and the traditional pH-sensitive dye, BCECF, reported cytosolic pH similarly in pH-clamped HEK293 cells. Cells were incubated at the permissive pH for H(+)-coupled nucleoside transport, pH 5.5, under both Na(+)-free and Na(+)-containing conditions. In mNect.hCNT3-expressing cells (but not under negative control conditions) the rate of acidification increased in media containing 0.5 mm uridine, providing the first direct evidence for H(+)-coupled uridine transport. At pH 5.5, there was no significant difference in uridine transport rates (coupled H+ flux) in the presence or absence of Na+ (1.09 +/- 0.11 or 1.18 +/- 0.32 mm min(-1), respectively). This suggests that in acidic Na(+)-containing conditions, 1 Na+ and 1 H+ are transported per uridine molecule, while in acidic Na(+)-free conditions, 1 H+ alone is transported/uridine. In acid environments, including renal proximal tubule, H+/nucleoside co-transport may drive nucleoside accumulation by hCNT3. Fusion of mNect to hCNT3 provided a simple, self-referencing, and effective way to monitor nucleoside transport, suggesting an approach that may have applications in assays of transport activity of other H(+)-coupled transport proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,739

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle