Gene Expression Profiling of Acute Liver Stress During Living Donor Liver Transplantation
Notice bibliographique
Résumé
During liver transplantation, the donor graft is subjected to a number of acute stresses whose molecular basis is not well-understood. The effects of surgical stress, preservation and reperfusion injury were studied in 24 consecutive living donor liver transplant (LDLT) operations. Liver biopsies were taken early in the donor operation (OPENING), after transection of the donor liver (PRECLAMP) and following implantation of the graft (post hepatic artery, [PHA]); these were evaluated for histology, tissue glutathione content and gene expression using a 19K-human cDNA microarray. LDLT was associated with an ischemia/reperfusion injury, with accumulation of small numbers of neutrophils and decreased glutathione in the PHA biopsies. Following reperfusion, the expression of 129 genes increased and 106 genes decreased when compared to OPENING levels (> or <2-fold, p < 0.01). By real-time PCR a subset of 25 genes was verified (15 increased, 10 decreased). These genes were similarly altered in another condition of acute liver stress (the response to brain-death), but not in three chronic liver disease states (HCV, HBV and PBC). This study has identified a set of genes whose expression is altered in acute, but not chronic, liver stress, likely to play a central role in the pathogenesis of acute liver injury of liver transplantation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».