<i>SOD1</i>, <i>ANG</i>, <i>VAPB</i>, <i>TARDBP</i>, and <i>FUS</i> mutations in familial amyotrophic lateral sclerosis: genotype–phenotype correlations
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Mutations in SOD1, ANG, VAPB, TARDBP and FUS genes have been identified in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). METHODS: The relative contributions of the different mutations to ALS were estimated by systematically screening a cohort of 162 families enrolled in France and 500 controls (1000 chromosomes) using molecular analysis techniques and performing phenotype-genotype correlations. RESULTS: 31 pathogenic missense mutations were found in 36 patients (20 SOD1, 1 ANG, 1 VAPB, 7 TARDBP and 7 FUS). Surprisingly two FUS mutation carriers also harboured ANG variants. One family of Japanese origin with the P56S VAPB mutation was identified. Seven novel mutations (three in SOD1, two in TARDBP, two in FUS) were found. None of them was detected in controls. Segregation of detected mutations with the disease was confirmed in 11 families including five pedigrees carrying the novel mutations. Clinical comparison of SOD1, TARDBP, FUS and other familial ALS patients (with no mutation in the screened genes) revealed differences in site of onset (predominantly lower limbs for SOD1 and upper limbs for TARDBP mutations), age of onset (younger with FUS mutations), and in lifespan (shorter for FUS carriers). One third of SOD1 patients survived more than 7 years: these patients had earlier disease onset than those presenting with a more typical course. Differences were also observed among FUS mutations, with the R521H FUS mutation being associated with longer disease duration. CONCLUSIONS: This study identifies new genetic associations with ALS and provides phenotype-genotype correlations with both previously reported and novel mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».