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Enregistrement W2157108110 · doi:10.1136/jmg.2010.077180

<i>SOD1</i>, <i>ANG</i>, <i>VAPB</i>, <i>TARDBP</i>, and <i>FUS</i> mutations in familial amyotrophic lateral sclerosis: genotype–phenotype correlations

2010· article· en· W2157108110 sur OpenAlexaff
Stéphanie Millecamps, François Salachas, C. Cazeneuve, Bernard Bricka, A. Camuzat, Léna Guillot‐Noël, Odile Russaouen, Gaëlle Bruneteau, Pierre‐François Pradat, Nadine Le Forestier, N. Vandenberghe, Véronique Danel-Brunaud, Nathalie Guy, Christel Thauvin-Robinet, Lucette Lacomblez, P. Couratier, Didier Hannequin, Danielle Seilhean, Isabelle Le Ber, William Camu, Alexis Brice, Guy A. Rouleau, Eric Leguern, Vincent Meininger

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesAssociation pour la Recherche sur la Sclérose Latérale Amyotrophique et autres Maladies du Motoneurone
Mots-clésTARDBPAmyotrophic lateral sclerosisMissense mutationGeneticsMutationSOD1BiologyPhenotypeGenotypeGeneMedicineDiseasePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mutations in SOD1, ANG, VAPB, TARDBP and FUS genes have been identified in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). METHODS: The relative contributions of the different mutations to ALS were estimated by systematically screening a cohort of 162 families enrolled in France and 500 controls (1000 chromosomes) using molecular analysis techniques and performing phenotype-genotype correlations. RESULTS: 31 pathogenic missense mutations were found in 36 patients (20 SOD1, 1 ANG, 1 VAPB, 7 TARDBP and 7 FUS). Surprisingly two FUS mutation carriers also harboured ANG variants. One family of Japanese origin with the P56S VAPB mutation was identified. Seven novel mutations (three in SOD1, two in TARDBP, two in FUS) were found. None of them was detected in controls. Segregation of detected mutations with the disease was confirmed in 11 families including five pedigrees carrying the novel mutations. Clinical comparison of SOD1, TARDBP, FUS and other familial ALS patients (with no mutation in the screened genes) revealed differences in site of onset (predominantly lower limbs for SOD1 and upper limbs for TARDBP mutations), age of onset (younger with FUS mutations), and in lifespan (shorter for FUS carriers). One third of SOD1 patients survived more than 7 years: these patients had earlier disease onset than those presenting with a more typical course. Differences were also observed among FUS mutations, with the R521H FUS mutation being associated with longer disease duration. CONCLUSIONS: This study identifies new genetic associations with ALS and provides phenotype-genotype correlations with both previously reported and novel mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations296
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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