MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2157279932 · doi:10.1371/journal.ppat.0030165

T Cell Responses to Human Endogenous Retroviruses in HIV-1 Infection

2007· article· en· W2157279932 sur OpenAlexaff
Keith Garrison, R. Brad Jones, Duncan A. Meiklejohn, Naveed Anwar, Lishomwa C. Ndhlovu, Joan M. Chapman, Ann L. Erickson, Ashish Agrawal, Gerald Spotts, Frederick Hecht, Seth Rakoff-Nahoum, Jack Lenz, Mario Ostrowski, Douglas F. Nixon

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFaculty of Medical and Health Sciences, University of AucklandNational Institutes of Health
Mots-clésELISPOTBiologyVirologyCytotoxic T cellImmunologyT cellCD8Viral loadImmune systemAntigenVirusGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human endogenous retroviruses (HERVs) are remnants of ancient infectious agents that have integrated into the human genome. Under normal circumstances, HERVs are functionally defective or controlled by host factors. In HIV-1-infected individuals, intracellular defense mechanisms are compromised. We hypothesized that HIV-1 infection would remove or alter controls on HERV activity. Expression of HERV could potentially stimulate a T cell response to HERV antigens, and in regions of HIV-1/HERV similarity, these T cells could be cross-reactive. We determined that the levels of HERV production in HIV-1-positive individuals exceed those of HIV-1-negative controls. To investigate the impact of HERV activity on specific immunity, we examined T cell responses to HERV peptides in 29 HIV-1-positive and 13 HIV-1-negative study participants. We report T cell responses to peptides derived from regions of HERV detected by ELISPOT analysis in the HIV-1-positive study participants. We show an inverse correlation between anti-HERV T cell responses and HIV-1 plasma viral load. In HIV-1-positive individuals, we demonstrate that HERV-specific T cells are capable of killing cells presenting their cognate peptide. These data indicate that HIV-1 infection leads to HERV expression and stimulation of a HERV-specific CD8+ T cell response. HERV-specific CD8+ T cells have characteristics consistent with an important role in the response to HIV-1 infection: a phenotype similar to that of T cells responding to an effectively controlled virus (cytomegalovirus), an inverse correlation with HIV-1 plasma viral load, and the ability to lyse cells presenting their target peptide. These characteristics suggest that elicitation of anti-HERV-specific immune responses is a novel approach to immunotherapeutic vaccination. As endogenous retroviral sequences are fixed in the human genome, they provide a stable target, and HERV-specific T cells could recognize a cell infected by any HIV-1 viral variant. HERV-specific immunity is an important new avenue for investigation in HIV-1 pathogenesis and vaccine design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS PathogensMême sujetChromosomal and Genetic VariationsTravaux en français237 207