Haplotype association study between <i>DRD1</i> gene and bipolar type I affective disorder in two samples from Canada and Sardinia
Notice bibliographique
Résumé
Based on the dopaminergic hypothesis, the dopamine D(1) receptor gene (DRD1) is considered to be a good candidate gene involved in the susceptibility of bipolar disorder (BP). Genetic association between three DRD1 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (-800T/C, -48A/G, and 1403T/C) and bipolar type I (BP I) disorder was performed in a case-control sample of Sardinian origin (170 BP I and 209 controls) and in an enlarged sample (229 families) of BP I trios from Toronto. The haplotype analyses generated significant global chi-square in both samples (P-value 0.024 in Toronto and 0.00042 in Sardinian). The main representative haplotypes in both samples were the -800T/-48A/1403C and the -800C/-48G/1403T. Considering each group individually, the -800C/-48G/1403T was transmitted more frequently from parents to BP I probands in Toronto sample (nominally P-value = 0.047) and was more frequent in cases than in control subjects in Sardinian sample although showing no significant evidence of association (nominally P-value = 0.16) When the estimated haplotype counts of both samples were combined, the global chi(2) was significant (P-value = 0.00085) and the nominal P-value for the haplotype -800C/-48G/1403T was 0.01. The fact that the same haplotype shows a similar trend for association in samples originating from different ethnic backgrounds seems to imply that the -800C/-48G/1403T haplotype may be considered as a risk factor for BP I disorder.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».