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Enregistrement W2157536440 · doi:10.1128/jvi.02128-08

Comparisons of CD8<sup>+</sup>T Cells Specific for Human Immunodeficiency Virus, Hepatitis C Virus, and Cytomegalovirus Reveal Differences in Frequency, Immunodominance, Phenotype, and Interleukin-2 Responsiveness

2009· article· en· W2157536440 sur OpenAlexaff
Prasanna Jagannathan, Christine Osborne, Cassandra Royce, Maura Manion, John C. Tilton, Li Li, Steven H. Fischer, Claire W. Hallahan, Julia A. Metcalf, Mary McLaughlin, Matthew R. Pipeling, John F. McDyer, Thomas Manley, Jeffery L. Meier, John D. Altman, Laura Hertel, Richard T. Davey, Mark Connors, Stephen A. Migueles

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBiologyImmunodominanceVirologyCD8ViremiaImmunologyCytomegalovirusHepatitis C virusVirusImmune systemCytotoxic T cellT cellCoinfectionHuman cytomegalovirusViral diseaseHerpesviridaeGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To better understand the components of an effective immune response to human immunodeficiency virus (HIV), the CD8(+) T-cell responses to HIV, hepatitis C virus (HCV), and cytomegalovirus (CMV) were compared with regard to frequency, immunodominance, phenotype, and interleukin-2 (IL-2) responsiveness. Responses were examined in rare patients exhibiting durable immune-mediated control over HIV, termed long-term nonprogressors (LTNP) or elite controllers, and patients with progressive HIV infection (progressors). The magnitude of the virus-specific CD8(+) T-cell response targeting HIV, CMV, and HCV was not significantly different between LTNP and progressors, even though their capacity to proliferate to HIV antigens was preserved only in LTNP. In contrast to HIV-specific CD8(+) T-cell responses of LTNP, HLA B5701-restricted responses within CMV pp65 were rare and did not dominate the total CMV-specific response. Virus-specific CD8(+) T cells were predominantly CD27(+)45RO(+) for HIV and CD27(-)45RA(+) for CMV; however, these phenotypes were highly variable and heavily influenced by the degree of viremia. Although IL-2 induced significant expansions of CMV-specific CD8(+) T cells in LTNP and progressors by increasing both the numbers of cells entering the proliferating pool and the number of divisions, the proliferative capacity of a significant proportion of HIV-specific CD8(+) T cells was not restored with exogenous IL-2. These results suggest that immunodominance by HLA B5701-restricted cells is specific to HIV infection in LTNP and is not a feature of responses to other chronic viral infections. They also suggest that poor responsiveness to IL-2 is a property of HIV-specific CD8(+) T cells of progressors that is not shared with responses to other viruses over which immunologic control is maintained.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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