The effect of human GATA4 gene mutations on the activity of target gonadal promoters
Notice bibliographique
Résumé
GATA transcription factors are crucial regulators of cell-specific gene expression in many tissues including the gonads. Although clinical cases of reproductive dysfunction have yet to be formally linked to GATA gene mutations, they have begun to be reported in other systems. Heterozygous GATA4 mutations have been associated with cases of congenital heart defects. Little is known, however, about the effect of these mutations on gonadal gene transcription. Since individuals carrying these mutations do not appear to suffer from gross reproductive defects, we hypothesized that this might be due to the differential transcriptional properties of the mutant proteins on heart versus gonadal target genes. Five mutations (S52F, E215D, G295S, V266M, and E359X) were recreated in the rat GATA4 protein. Several parameters were used to analyze the transcriptional properties of the mutants: activation of known gonadal target promoters (Star, Cyp19a1, and Inha), DNA binding, and interaction with GATA4 transcriptional partners. Three mutations (S52F, G295S, and E359X) reduced GATA4 transcriptional activity on the different gonadal promoters. With the exception of the G295S mutant, which showed a significant loss of DNA-binding affinity, the decrease in activity of the other GATA4 mutants was not associated with a change in DNA binding. All GATA4 mutants retained their ability to interact and cooperate with their major gonadal partners (NR5A1 and NR5A2) thereby compensating in part for the loss in intrinsic GATA4 transcriptional activity. Thus, unlike the heart, where the GATA4 mutations have deleterious effects, our data suggest that they would have a lesser impact on gonadal gene transcription and function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».