MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2157615421 · doi:10.1677/jme-08-0089

The effect of human GATA4 gene mutations on the activity of target gonadal promoters

2008· article· en· W2157615421 sur OpenAlexaff
Marie France Bouchard, Hiroaki Taniguchi, Robert S. Viger

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGATA4PromoterBiologyMutantGeneGeneticsTranscription (linguistics)Transcriptional regulationTranscription factorMutationCell biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GATA transcription factors are crucial regulators of cell-specific gene expression in many tissues including the gonads. Although clinical cases of reproductive dysfunction have yet to be formally linked to GATA gene mutations, they have begun to be reported in other systems. Heterozygous GATA4 mutations have been associated with cases of congenital heart defects. Little is known, however, about the effect of these mutations on gonadal gene transcription. Since individuals carrying these mutations do not appear to suffer from gross reproductive defects, we hypothesized that this might be due to the differential transcriptional properties of the mutant proteins on heart versus gonadal target genes. Five mutations (S52F, E215D, G295S, V266M, and E359X) were recreated in the rat GATA4 protein. Several parameters were used to analyze the transcriptional properties of the mutants: activation of known gonadal target promoters (Star, Cyp19a1, and Inha), DNA binding, and interaction with GATA4 transcriptional partners. Three mutations (S52F, G295S, and E359X) reduced GATA4 transcriptional activity on the different gonadal promoters. With the exception of the G295S mutant, which showed a significant loss of DNA-binding affinity, the decrease in activity of the other GATA4 mutants was not associated with a change in DNA binding. All GATA4 mutants retained their ability to interact and cooperate with their major gonadal partners (NR5A1 and NR5A2) thereby compensating in part for the loss in intrinsic GATA4 transcriptional activity. Thus, unlike the heart, where the GATA4 mutations have deleterious effects, our data suggest that they would have a lesser impact on gonadal gene transcription and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Molecular EndocrinologyMême sujetCongenital heart defects researchTravaux en français237 207