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Enregistrement W2157655537 · doi:10.1099/mic.0.038562-0

Mutations affecting the extreme C terminus of Escherichia coli haemolysin A reduce haemolytic activity by altering the folding of the toxin

2010· article· en· W2157655537 sur OpenAlexaff
Thorsten Jumpertz, Christian Chervaux, Kathleen I. Racher, Maria Zouhair, Mark A. Blight, I. Barry Holland, Lutz Schmitt

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensAboriginal Affairs Northern Dev Canada
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueAssociation pour la Recherche sur le Cancer
Mots-clésEscherichia coliMutantSecretionHemolysinChromosomal translocationMutationBiologyToxinWild typeBiochemistryGeneVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Escherichia coli haemolysin A (HlyA), an RTX toxin, is secreted probably as an unfolded intermediate, by the type I (ABC transporter-dependent) pathway, utilizing a C-terminal secretion signal. However, the mechanism of translocation and post-translocation folding is not understood. We identified a mutation (hlyA99) at the extreme C terminus, which is dominant in competition experiments, blocking secretion of the wild-type toxin co-expressed in the same cell. This suggests that unlike recessive mutations which affect recognition of the translocation machinery, the hlyA99 mutation interferes with some later step in secretion. Indeed, the mutation reduced haemolytic activity of the toxin and the activity of beta-lactamase when the latter was fused to a C-terminal 23 kDa fragment of HlyA carrying the hlyA99 mutation. A second mutant (hlyAdel6), lacking the six C-terminal residues of HlyA, also showed reduced haemolytic activity and neither mutant protein regained normal haemolytic activity in in vitro unfolding/refolding experiments. Tryptophan fluorescence spectroscopy indicated differences in structure between the secreted forms of wild-type HlyA and the HlyA Del6 mutant. These results suggested that the mutations affected the correct folding of both HlyA and the beta-lactamase fusion. Thus, we propose a dual function for the HlyA C terminus involving an important role in post-translocation folding as well as targeting HlyA for secretion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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