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Enregistrement W2157686336 · doi:10.1128/jb.01555-09

The Minor Pilin Subunit Sgp2 Is Necessary for Assembly of the Pilus Encoded by the<i>srtG</i>Cluster of<i>Streptococcus suis</i>

2010· article· en· W2157686336 sur OpenAlexaff
Masatoshi Okura, Makoto Osaki, Nahuel Fittipaldi, Marcelo Gottschalk, Tsutomu Sekizaki, Daisuke Takamatsu

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPilinPilusSortaseBiologyProtein subunitFimbriae ProteinsGene clusterMutantMicrobiologyGeneGeneticsEscherichia coliBacterial protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gram-positive pili are composed of covalently bound pilin subunits whose assembly is mediated via a pilus-specific sortase(s). Major subunits constitute the pilus backbone and are therefore essential for pilus formation. Minor subunits are also incorporated into the pilus, but they are considered to be dispensable for backbone formation. The srtG cluster is one of the putative pilus gene clusters identified in the major swine pathogen Streptococcus suis. It consists of one sortase gene (srtG) and two putative pilin subunit genes (sgp1 and sgp2). In this study, by constructing mutants for each of the genes in the cluster and by both immunoblotting and immunogold electron microscopic analysis with antibodies against Sgp1 and Sgp2, we found that the srtG cluster mediates the expression of pilus-like structures in S. suis strain 89/1591. In this pilus, Sgp1 forms the backbone, whereas Sgp2 is incorporated as the minor subunit. In accordance with the current model of pilus assembly by Gram-positive organisms, the major subunit Sgp1 was indispensable for backbone formation and the cognate sortase SrtG mediated the polymerization of both subunits. However, unlike other well-characterized Gram-positive bacterial pili, the minor subunit Sgp2 was required for polymerization of the major subunit Sgp1. Because Sgp2 homologues are encoded in several other Gram-positive bacterial pilus gene clusters, in some types of pili, minor pilin subunits may contribute to backbone formation by a novel mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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