Time dependence of biomarkers: non-proportional effects of immunohistochemical panels predicting relapse risk in early breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: We investigated the impact of follow-up duration to determine whether two immunohistochemical prognostic panels, IHC4 and Mammostrat, provide information on the risk of early or late distant recurrence using the Edinburgh Breast Conservation Series and the Tamoxifen vs Exemestane Adjuvant Multinational (TEAM) trial. METHODS: The multivariable fractional polynomial time (MFPT) algorithm was used to determine which variables had possible non-proportional effects. The performance of the scores was assessed at various lengths of follow-up and Cox regression modelling was performed over the intervals of 0-5 years and >5 years. RESULTS: We observed a strong time dependence of both the IHC4 and Mammostrat scores, with their effects decreasing over time. In the first 5 years of follow-up only, the addition of both scores to clinical factors provided statistically significant information (P<0.05), with increases in R(2) between 5 and 6% and increases in D-statistic between 0.16 and 0.21. CONCLUSIONS: Our analyses confirm that the IHC4 and Mammostrat scores are strong prognostic factors for time to distant recurrence but this is restricted to the first 5 years after diagnosis. This provides evidence for their combined use to predict early recurrence events in order to select those patients who may/will benefit from adjuvant chemotherapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,022 | 0,053 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».