<i>Chlamydophila pneumoniae</i> PknD Exhibits Dual Amino Acid Specificity and Phosphorylates Cpn0712, a Putative Type III Secretion YscD Homolog
Notice bibliographique
Résumé
Chlamydophila pneumoniae is an obligate intracellular bacterium that causes bronchitis, pharyngitis, and pneumonia and may be involved in atherogenesis and Alzheimer's disease. Genome sequencing has identified three eukaryote-type serine/threonine protein kinases, Pkn1, Pkn5, and PknD, that may be important signaling molecules in Chlamydia. Full-length PknD was cloned and expressed as a histidine-tagged protein in Escherichia coli. Differential centrifugation followed by sodium carbonate treatment of E. coli membranes demonstrated that His-PknD is an integral membrane protein. Fusions of overlapping PknD fragments to alkaline phosphatase revealed that PknD contains a single transmembrane domain and that the kinase domain is in the cytoplasm. To facilitate solubility, the kinase domain was cloned and expressed as a glutathione S-transferase (GST) fusion protein in E. coli. Purified GST-PknD kinase domain autophosphorylated, and catalytic mutants (K33G, D156G, and K33G-D156G mutants) and activation loop mutants (T185A and T193A) were inactive. PknD phosphorylated recombinant Cpn0712, a type III secretion YscD homolog that has two forkhead-associated domains. Thin-layer chromatography revealed that the PknD kinase domain autophosphorylated on threonine and tyrosine and phosphorylated the FHA-2 domain of Cpn0712 on serine and tyrosine. To our knowledge, this is the first demonstration of a bacterial protein kinase with amino acid specificity for both serine/threonine and tyrosine residues and this is the first study to show phosphorylation of a predicted type III secretion structural protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».