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Enregistrement W2158116090 · doi:10.1111/j.1540-8167.2006.00402.x

Mathematical Simulations of the Effects of Altered AMP‐Kinase Activity on I<sub>Na</sub> and the Action Potential in Rat Ventricle

2006· article· en· W2158116090 sur OpenAlexaff
Hojjat Bazzazi, Robert B. Clark, Wayne R. Giles

Notice bibliographique

RevueJournal of Cardiovascular Electrophysiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiophysicsVentricleProtein kinase AElectrophysiologyVentricular action potentialMembrane potentialKinaseSteady state (chemistry)Internal medicineEndocrinologyMedicineCell biologyChemistryBiologyRepolarization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Alterations in the activity of a so-called "metabolic switch" enzyme, adenosine monophosphate-activated protein kinase (AMP kinase), in mammalian heart contribute to the conduction abnormalities and rhythm disturbances in the settings of Wolff-Parkinson-White syndrome and ventricular pre-excitation. A recent study by Light et al. has shown that augmented AMP kinase activity can alter the biophysical properties of mammalian cardiac sodium currents. These experiments involved an electrophysiological analysis following heterologous expression of human Na(v)1.5 in tsA201 cells. Constitutive activation of AMP kinase followed by co-transfection caused: (i) a hyperpolarizing shift in the activation curve for I(Na), (ii) a small change in the voltage dependence of steady-state inactivation, and (iii) a significant slowing in the rate of inactivation of I(Na). METHODS AND RESULTS: We have attempted to simulate these results using our mathematical model of the membrane action potential of the adult rat ventricular myocyte. The changes in I(Na) produced by AMP kinase activation and/or overexpression can be reconstructed mathematically by altering two rate constants in a Markovian model that governs the I(Na) kinetics. Simulated macroscopic I(Na) records in which a fraction (10-100%) of the Na(+) channels had the appropriate rate constants for two state-dependent transitions increased by a factor of 100-fold exhibited: (i) slowed inactivation, (ii) a shift in steady-state activation to more hyperpolarized membrane potentials, and (iii) a very small change in the voltage dependence of steady-state inactivation. SUMMARY: Thus, straightforward modifications of a previously published kinetic scheme for the time and voltage dependence of mammalian heart I(Na), when incorporated into a mathematical model for the rat ventricular action potential can reproduce the main features of these AMP kinase-induced modifications in I(Na) in mammalian ventricle. Ongoing mathematical simulations are directed toward developing formulations that mimic the molecular mechanisms for the AMP kinase effects, e.g., changes in the kinetics of I(Na) resulting from selective phosphorylation/dephosphorylation of sites on the alpha or beta subunits which comprise human Na(v)1.5. Thereafter, incorporation of these changes into a mathematical model for the action potential of the human ventricular myocyte is planned.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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