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Enregistrement W2158234373 · doi:10.1105/tpc.114.126862

The Structure of the Catalytic Domain of a Plant Cellulose Synthase and Its Assembly into Dimers

2014· article· en· W2158234373 sur OpenAlexaff
Anna T. Olek, Catherine Rayon, Lee Makowski, Hyung Rae Kim, Peter N. Ciesielski, John Badger, Lake N. Paul, Subhangi Ghosh, Daisuke Kihara, Michael F. Crowley, Michael E. Himmel, Jeffrey T. Bolin, Nicholas C. Carpita

Notice bibliographique

RevueThe Plant Cell · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensDelta-Q Technologies (Canada)
Organismes subventionnairesArgonne National LaboratoryBasic Energy SciencesBrookhaven National LaboratoryNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of General Medical SciencesOffice of ScienceNational Research FoundationNational Research Foundation of KoreaU.S. Department of EnergyNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMonomerDimerCelluloseATP synthaseChemistryCell wallMicrofibrilCrystallographyStereochemistryEnzymeBiochemistryPolymerOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellulose microfibrils are para-crystalline arrays of several dozen linear (1→4)-β-d-glucan chains synthesized at the surface of the cell membrane by large, multimeric complexes of synthase proteins. Recombinant catalytic domains of rice (Oryza sativa) CesA8 cellulose synthase form dimers reversibly as the fundamental scaffold units of architecture in the synthase complex. Specificity of binding to UDP and UDP-Glc indicates a properly folded protein, and binding kinetics indicate that each monomer independently synthesizes single glucan chains of cellulose, i.e., two chains per dimer pair. In contrast to structure modeling predictions, solution x-ray scattering studies demonstrate that the monomer is a two-domain, elongated structure, with the smaller domain coupling two monomers into a dimer. The catalytic core of the monomer is accommodated only near its center, with the plant-specific sequences occupying the small domain and an extension distal to the catalytic domain. This configuration is in stark contrast to the domain organization obtained in predicted structures of plant CesA. The arrangement of the catalytic domain within the CesA monomer and dimer provides a foundation for constructing structural models of the synthase complex and defining the relationship between the rosette structure and the cellulose microfibrils they synthesize.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,174
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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