Functional and evolutionary analysis of two CBF genes in <i>Prunus mume</i>
Notice bibliographique
Résumé
Zhang, J., Yang, W. R., Cheng, T. R., Pan, H. T. and Zhang, Q. X. 2013. Functional and evolutionary analysis of two CBF genes in Prunus mume . Can. J. Plant Sci. 93: 455–464. Primers based on the C-repeat (CRT)/dehydration responsive element (DRE) binding factor of peach (Prunus persica), sweet cherry (Prunus avim) and other related family member sequences found in GenBank were designed. Fragments of C-repeat binding factor (CBF) genes were isolated from Prunus mume by PCR and RT-PCR. The two CBF genes, designated PmCBFa and PmCBFb, were 821 bp and 741 bp long, encoding putative proteins of 238 and 225 amino acids, respectively, which contain all the conserved CBF protein domains. Similar to other CBF homologs, PmCBFa and PmCBFb may be constitutive and can be induced at a low temperature. Phylogenetic analysis using known CBF homologs indicated that all monocot CBF genes belong to the same group, separated from the eudicot CBF genes. The PmCBF genes are the homologs of the sweet cherry PaDREB gene. Sequencing of 16 cultivars and a wild species, ‘Zang’ Mei, characterized the intraspecific molecular evolution of the Prunus mume CBF genes, and the preliminary analysis indicates that the nucleotide diversity is low in coding area of PmCBFa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».