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Enregistrement W2158359239 · doi:10.1677/joe-09-0034

Two divergent leptin paralogues in zebrafish (Danio rerio) that originate early in teleostean evolution

2009· article· en· W2158359239 sur OpenAlex
Marnix Gorissen, Nicholas J. Bernier, Sander B. Nabuurs, Gert Flik, Mark O. Huising

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Endocrinology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishDanioLeptinBiologyGeneSyntenyGeneticsOryziasPhylogenetic treeLeptin receptorInternal medicineEndocrinologyGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe duplicate leptin genes in zebrafish (Danio rerio) that share merely 24% amino acid identity with each other and only 18% with human leptin. We were also able to retrieve a second leptin gene in medaka (Oryzias latipes). The presence of duplicate leptin genes in these two distantly related teleosts suggests that duplicate leptin genes are a common feature of teleostean fishes. Despite low primary sequence conservation, we are confident in assigning orthology between mammalian and zebrafish leptins for several reasons. First, both zebrafish leptins share their characteristic gene structure and display key features of conserved synteny with mammalian leptin genes. Secondly, the cysteine residues that make up leptin's single disulphide bridge are equally spaced in mammalian and zebrafish leptins and are unique among all members of the class-I helical cytokine family. Thirdly, the zebrafish leptins cluster with other fish leptins and mammalian leptins in phylogenetic analysis, supported by high bootstrap values. Within the leptin cluster, leptin-b forms a separate clade with the leptin-b orthologue from medaka. Finally, our prediction of the tertiary structures shows that both leptins conform to the typical four alpha-helix bundle structure of the class-I alpha-helical cytokines. The zebrafish leptins are differentially expressed; the liver shows high leptin-a expression (in concordance with what we observed for carp leptins), while leptin-b is expressed at much lower levels, which are downregulated further upon fasting. The finding of duplicate leptin genes in teleosts adds to our understanding of the evolution of leptin physiology in the early vertebrate lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,468

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle