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Enregistrement W2158381779 · doi:10.1016/j.juro.2007.03.092

Prostatic Stem Cell Marker Identified by cDNA Microarray in Mouse

2007· article· en· W2158381779 sur OpenAlexfundno aff
Akira Tsujimura, Kazutoshi Fujita, Kazuhiko Komori, Tetsuya Takao, Yasushi Miyagawa, Shingo Takada, Kiyomi Matsumiya, Norio Nonomur, Äkïhïko Okuyama

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Urology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork University
Mots-clésStem cellStem cell markerPopulationBiologyTelomerase reverse transcriptasePathologyProstateImmunostainingMedicineCell biologyTelomeraseImmunohistochemistryGeneCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Identifying prostatic stem cells is important to elucidate the mechanisms by which the prostate develops and control prostate cancer. We recently reported that the proximal region of the mouse prostate contains a population of stem cells. However, to our knowledge the specific marker of stem cells in the proximal region remains unknown. MATERIALS AND METHODS: We performed cDNA microarray analysis of cells obtained from the proximal region and from the remaining regions in dorsal prostates to identify several candidate stem cell markers. After we focused on 1 candidate among them we confirmed the expression of this candidate gene by reverse transcriptase-polymerase chain reaction analysis and immunohistochemistry. We also investigated the relation between positive cells for this marker and those for telomerase reverse transcriptase. Finally, we investigated the functional potential of prominin positive cells in 3-dimensional culture. RESULTS: Seven of 4,800 genes analyzed showed proximal/remaining ratios greater than 20. Of these genes we focused on prominin because it is a cell surface marker widely used to identify and isolate stem cells from various organs. We found a prominin positive cell population enriched in the basal cell layer in the proximal region, and the coincidence of prominin and telomerase reverse transcriptase immunostaining. We also found that prominin positive cells gave rise to numerous and large-branched ducts, whereas prominin negative cells formed far fewer such structures in 3-dimensional culture. CONCLUSIONS: A small population of prominin positive cells in the mouse prostate basal layer of the proximal region represents a stem cell population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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