Diacidic Motifs Influence the Export of Transmembrane Proteins from the Endoplasmic Reticulum in Plant Cells
Notice bibliographique
Résumé
In yeast and mammals, amino acid motifs in the cytosolic tails of transmembrane domains play a role in protein trafficking by facilitating export from the endoplasmic reticulum (ER). However, little is known about ER export signals of membrane proteins in plants. Therefore, we investigated the role of diacidic motifs in the ER export of Golgi-localized membrane proteins. We show that diacidic motifs perform a significant function in the export of transmembrane proteins to the Golgi apparatus, as mutations of these signals impede the efficient anterograde transport of multispanning, type II, and type I proteins. Furthermore, we demonstrate that diacidic motifs instigate the export of proteins that reside in the ER due to the lengths of their transmembrane domains. However, not all of the diacidic motifs in the cytosolic tails of the proteins studied were equally important in ER export. Transport of Golgi proteins was disrupted only by mutagenesis of specific diacidic signals, suggesting that the protein environment of these signals affects their function. Our findings indicate that diacidic ER export motifs are present and functional in plant membrane proteins and that they are dominant over transmembrane domain length in determining the export of proteins from the ER in plant cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».