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Enregistrement W2158401745 · doi:10.1002/prot.1066

Crystal structure of an aldehyde reductase Y50F mutant‐NADP complex and its implications for substrate binding

2001· article· en· W2158401745 sur OpenAlexaff
Qilu Ye, David Hyndman, Nancy Green, Xuhong Li, Bryan Korithoski, Zongchao Jia, T. Geoffrey Flynn

Notice bibliographique

RevueProteins Structure Function and Bioinformatics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAldose Reductase and Taurine
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCofactorTernary complexStereochemistryAldehydeChemistryAldehyde ReductaseTyrosineActive siteBinding siteEnzymeMutantSubstrate (aquarium)ReductaseOxidoreductasePhenylalanineBiochemistryCatalysisBiologyAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pig aldehyde reductase containing the active site mutation tyrosine(50) to phenylalanine has been crystallized in the presence of the cofactor NADP(H) to a resolution of 2.2 A. This structure clearly shows loss of the tyrosine hydroxyl group and no other significant perturbations compared with previously determined structures. The mutant binds cofactor (both oxidized and reduced) more tightly than the wild-type enzyme but shows a complete lack of binding of the aldehyde reductase inhibitor barbitone, as determined by fluorescence titrations. Numerous attempts at preparing a ternary complex with a range of small aldehyde substrates were unsuccessful. This result, in addition to the inability of the mutant protein to bind the inhibitor, provides strong evidence for the proposal that the tyrosine hydroxyl group is essential for substrate binding in addition to catalysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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