MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2158413492 · doi:10.1002/anie.201508555

Specificity of the Metalloregulator CueR for Monovalent Metal Ions: Possible Functional Role of a Coordinated Thiol?

2015· article· en· W2158413492 sur OpenAlexaff
Dániel Szunyogh, Hajnalka Szokolai, Peter W. Thulstrup, Flemming H. Larsen, Béla Gyurcsik, N. J. Christensen, Monika Stachura, Lars Hemmingsen, Attila Jancsó

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie International Edition · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular Sensors and Ion Detection
Établissements canadiensTRIUMF
Organismes subventionnairesDanmarks Frie Forskningsfond
Mots-clésThiolMetal ions in aqueous solutionChemistryIonMetalBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metal-ion-responsive transcriptional regulators within the MerR family effectively discriminate between mono- and divalent metal ions. Herein we address the origin of the specificity of the CueR protein for monovalent metal ions. Several spectroscopic techniques were employed to study Ag(I) , Zn(II) , and Hg(II) binding to model systems encompassing the metal-ion-binding loop of CueR from E. coli and V. cholerae. In the presence of Ag(I) , a conserved cysteine residue displays a pKa value for deprotonation of the thiol that is close to the physiological pH value. This property is only observed with the monovalent metal ion. Quantum chemically optimized structures of the CueR metal site with Cys 112 protonated demonstrate that the conserved Ser 77 backbone carbonyl oxygen atom from the other monomer of the homodimer is "pulled" towards the metal site. A common allosteric mechanism of the metalloregulatory members of the MerR family is proposed. For CueR, the mechanism relies on the protonation of Cys 112.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,671

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAngewandte Chemie International EditionMême sujetMolecular Sensors and Ion DetectionTravaux en français237 207