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Enregistrement W2158432268 · doi:10.1186/1476-7961-8-5

Association of IL-4RA single nucleotide polymorphisms, HLA-DR and HLA-DQ in children with Alternaria-sensitive moderate-severe asthma

2010· article· en· W2158432268 sur OpenAlexaff
Alan P. Knutsen, Hari M. Vijay, Barbara Kariuki, Luís Ângelo Macêdo Santiago, Ralph J. Graff, Jonathan Wofford, Maulik R. Shah

Notice bibliographique

RevueClinical and Molecular Allergy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAsthmaSingle-nucleotide polymorphismImmunologyAlternariaHuman leukocyte antigenAllergyHLA-DQGenotypeGeneticsBiologyHaplotypeGeneAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Asthma afflicts 6% to 8% of the United States population, and severe asthma represents approximately 10% of asthmatic patients. Several epidemiologic studies in the United States and Europe have linked Alternaria sensitivity to both persistence and severity of asthma. In order to begin to understand genetic risk factors underlying Alternaria sensitivity and asthma, in these studies we examined T cell responses to Alternaria antigens, HLA Class II restriction and HLA-DQ protection in children with severe asthma. METHODS: Sixty children with Alternaria-sensitive moderate-severe asthma were compared to 49 children with Alternaria-sensitive mild asthma. We examined HLA-DR and HLA-DQ frequencies in Alternaria-sensitive asthmatic by HLA typing. To determine ratios of Th1/Th2 Alternaria-specific T-cells, cultures were stimulated in media alone, Alternaria alternata extract and Alt a1. Sensitivity to IL-4 stimulation was measured by up-regulation of CD23 on B cells. RESULTS: Children with Alternaria-sensitive moderate-severe asthma trended to have increased sensitivities to Cladosporium (46% versus 35%), to Aspergillus (43% versus 28%), and significantly increased sensitivities to trees (78% versus 57%) and to weeds (68% versus 48%). The IL-4RA ile75val polymorphism was significantly increased in Alternaria-sensitive moderate-severe asthmatics, 83% (0.627 allele frequency) compared to Alternaria-sensitive mild asthmatics, 57% (0.388 allele frequency). This was associated with increased sensitivity to IL-4 stimulation measured by significantly increased IL-4 stimulated CD23 expression on CD19+ and CD86+CD19+ B cells of Alternaria-sensitive moderate-severe asthmatics. IL-5 and IL-13 synthesis was significantly increased in Alternaria-sensitive moderate-severe asthmatics compared to mild asthmatics to Alternaria extract and Alt a1 stimulation. The frequency of HLA-DQB1*03 allele was significantly decreased in Alternaria-sensitive moderate-severe asthmatics compared to mild asthmatics, 39% versus 63%, with significantly decreased allele frequency, 0.220 versus 0.398. SUMMARY: In children with Alternaria-sensitive moderate severe asthma, there was an increased Th2 response to Alternaria stimulation and increased sensitivity to IL-4 stimulation. This skewing towards a Th2 response was associated with an increased frequency of the IL-4RA ile75val polymorphism. In evaluating the HLA association, there was a decreased frequency of HLA-DQB1*03 in Alternaria-sensitive moderate severe asthmatic children consistent with previous studies suggest that HLA-DQB1*03 may be protective against the development of mold-sensitive severe asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,530

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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