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Enregistrement W2158543265 · doi:10.1074/jbc.m006143200

Proteomics Characterization of Abundant Golgi Membrane Proteins

2001· article· en· W2158543265 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGolgi apparatusProteomicsCharacterization (materials science)Membrane proteinChemistryCell biologyBiologyComputational biologyMembraneNanotechnologyMaterials scienceBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A mass spectrometric analysis of proteins partitioning into Triton X-114 from purified hepatic Golgi apparatus (84% purity by morphometry, 122-fold enrichment over the homogenate for the Golgi marker galactosyl transferase) led to the unambiguous identification of 81 proteins including a novel Golgi-associated protein of 34 kDa (GPP34). The membrane protein complement was resolved by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and subjected to a hierarchical approach using delayed extraction matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry characterization by peptide mass fingerprinting, tandem mass spectrometry to generate sequence tags, and Edman sequencing of proteins. Major membrane proteins corresponded to known Golgi residents, a Golgi lectin, anterograde cargo, and an abundance of trafficking proteins including KDEL receptors, p24 family members, SNAREs, Rabs, a single ARF-guanine nucleotide exchange factor, and two SCAMPs. Analytical fractionation and gold immunolabeling of proteins in the purified Golgi fraction were used to assess the intra-Golgi and total cellular distribution of GPP34, two SNAREs, SCAMPs, and the trafficking proteins GBF1, BAP31, and alpha(2)P24 identified by the proteomics approach as well as the endoplasmic reticulum contaminant calnexin. Although GPP34 has never previously been identified as a protein, the localization of GPP34 to the Golgi complex, the conservation of GPP34 from yeast to humans, and the cytosolically exposed location of GPP34 predict a role for a novel coat protein in Golgi trafficking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle