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Enregistrement W2158602930 · doi:10.1086/527386

Temporal Changes in the Prevalence of Community-Acquired Antimicrobial-Resistant Urinary Tract Infection Affected by Escherichia coli Clonal Group Composition

2008· article· en· W2158602930 sur OpenAlexaff
S. P. Smith, Amee R. Manges, Lee W. Riley

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineEscherichia coliAntimicrobialUrinary systemMicrobiologyAntibiotic resistanceAntibioticsBiologyInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The changing prevalence of drug-resistant community-acquired urinary tract infection (UTI) is often attributed to local antimicrobial drug use or prescribing practices. However, recent molecular epidemiologic studies of community-acquired UTI suggest that other factors may play a greater role. METHODS: We conducted a multiyear, cross-sectional study to characterize temporal changes in the prevalence of drug-resistant community-acquired UTI at a university community in California. During four 3.5-month sampling periods, urine samples from patients consecutively presenting to the university health service with symptoms of UTI were cultured for Escherichia coli. Antimicrobial susceptibility and genotyping tests of the E. coli isolates were performed. RESULTS: We recovered 780 E. coli isolates from 1667 patients with UTI. The prevalence of trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, and nitrofurantoin resistance showed no trend over the 4 periods. The prevalence of ampicillin resistance decreased significantly over the last 2 study periods. A single clonal group accounted for 75% of this decrease. Enterobacterial repetitive intergenic consensus 2 PCR-based genotyping revealed that only 4 large clonal groups accounted for 52% of the UTIs resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, or nitrofurantoin. No initially pansusceptible clonal groups gained resistance over time. CONCLUSIONS: This study revealed no obvious trend in the prevalence of drug-resistant community-acquired UTI in a single community. Prevalence at any time was influenced by a small number of E. coli clonal groups. This observation suggests that the introduction of strains that are drug resistant into a community plays a greater role in changing the prevalence of drug-resistant UTI than does the drug use or prescribing habits in that community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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