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Enregistrement W2158815960 · doi:10.1128/iai.71.5.2534-2541.2003

Development of an Interleukin-12-Deficient Mouse Model That Is Permissive for Colonization by a Motile KE26695 Strain of <i>Helicobacter pylori</i>

2003· article· en· W2158815960 sur OpenAlexaff
Paul S. Hoffman, Neeraj Vats, Donna M. Hutchison, Jared Butler, Kenneth Chisholm, Gary Sisson, Aušra Raudonikiene, Jean S. Marshall, S. J. O. Veldhuyzen van Zanten

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobiologyColonizationHelicobacter pyloriMutantKnockout mouseGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification of genes associated with colonization and persistence of Helicobacter pylori in the gastric mucosa has been limited by the lack of robust animal models that support infection by strains whose genomes have been completely sequenced. Here we report that an interleukin-12 (IL-12)-deficient mouse (IL-12(-/-) p40 subunit knockout in C57BL/6 mouse) is permissive for infection by a motile variant (KE88-3887) of The Institute For Genomic Research-sequenced strain (KE26695) of H. pylori. The IL-12-deficient mouse was also more permissive for colonization by the mouse-colonizing Sydney 1 strain of H. pylori than were wild-type C57BL/6 mice. Differences in colonization efficiency were demonstrated by mouse challenge with SS1 strains containing loss-of-function mutations in two genes (hspR and hrcA), whose products negatively regulate several heat shock genes. At 5 weeks postinfection, double-knockout mutants (SS1 hspR hrcA) efficiently colonized IL-12-deficient mice (5 of 5 animals compared to 4 of 10 for C57BL6 mice) and bacterial counts were higher in stomachs of IL-12-deficient mice (10(6) versus 10(5) CFU/g of stomach, respectively). IL-12-deficient mice were efficiently colonized by KE88-3887 (29 of 30), but not by nonmotile KE26695, and bacterial numbers (10(4) to 10(5) CFU/g of stomach) were unchanged over an 8-week period postinfection. In contrast, C57BL/6 mice were inefficiently colonized by KE88-3887 (8 of 20 animals with bacterial loads at the limit of detection, approximately 10(3) CFU/g), and infection did not persist much beyond 5 weeks. Cytokine responses (tumor necrosis factor alpha and gamma interferon), pathology, and antral-predominant infection were indistinguishable between IL-12-deficient and C57BL/6 mice. The increased permissiveness of the IL-12-deficient mouse for infection with H. pylori should facilitate whole-genome-based strategies to study genes associated with virulence and immune modulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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