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Enregistrement W2159117635 · doi:10.1128/jvi.77.17.9359-9368.2003

Interferon Regulatory Factor 7 Regulates Expression of Epstein-Barr Virus Latent Membrane Protein 1: a Regulatory Circuit

2003· article· en· W2159117635 sur OpenAlexfundno aff
Shunbin Ning, Angela M. Hahn, Leslie E. Huye, Joseph S. Pagano

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteLudwig Institute for Cancer ResearchBrigham and Women's HospitalMcGill UniversityLady Davis Institute for Medical ResearchHarvard University
Mots-clésIRF7Interferon regulatory factorsBiologyInterferonTransfectionPromoterMolecular biologyTransactivationCell biologyVirus latencyTranscription factorVirologyVirusCell cultureGeneGene expressionViral replicationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have shown previously that interferon regulatory factor 7 (IRF7), a multifunctional protein intimately involved in latent Epstein-Barr virus (EBV) infection, is induced as well as activated by EBV latent membrane protein 1 (LMP1), the principal EBV oncoprotein. Since the LMP1 promoter (LMP1p) contains an interferon-stimulated response element (ISRE), we hypothesized that IRF7 might be able to regulate LMP1 expression and thus participate in a regulatory circuit between these two genes. In this study, IRF7 was shown first to activate LMP1p in transient transfection assays. Compared with EBV nuclear antigen 2 (EBNA2), the most potent viral transactivator of LMP1p, IRF7 has a lesser effect (approximately 10% that of EBNA2) on induction of LMP1p. Study with IRF7 deletion mutants showed that IRF7 functional domains have similar effects on both the beta interferon (IFN-beta) and LMP1 promoters in BJAB and 293 cells, and study with IRF7 phosphomimetic mutants showed that IRF7 phosphorylation may be involved in the activation of these two promoters. Further, the ISRE in LMP1p responds to IRF7 induction and IRF7 binds to this element. In the EBV-positive cell line P3HR1, which lacks the complete EBNA2 and EBV-encoded leader protein genes and hence expresses low-level LMP1, IRF7 alone can notably increase the endogenous LMP1 mRNA and protein levels. These results indicate that LMP1 is regulated by this host cell gene in addition to the viral factor, EBNA2, and may help to explain how LMP1 is expressed in type II latency in the absence of EBNA2. Moreover, IRF7 can regulate a viral gene in addition to a host cellular gene such as the IFN-beta gene. Together with the previous data that LMP1 can induce IRF7 expression and facilitate IRF7 phosphorylation and nuclear translocation, these results suggest a positive regulatory circuit between IRF7 and LMP1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,801

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations101
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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