Ancestry of neuronal monoamine transporters in the Metazoa
Notice bibliographique
Résumé
Selective Na(+)-dependent re-uptake of biogenic monoamines at mammalian nerve synapses is accomplished by three types of solute-linked carrier family 6 (SLC6) membrane transporter with high affinity for serotonin (SERTs), dopamine (DATs) and norepinephrine (NETs). An additional SLC6 monoamine transporter (OAT), is responsible for the selective uptake of the phenolamines octopamine and tyramine by insect neurons. We have characterized a similar high-affinity phenoloamine transporter expressed in the CNS of the earthworm Lumbricus terrestris. Phylogenetic analysis of its protein sequence clusters it with both arthropod phenolamine and chordate catecholamine transporters. To clarify the relationships among metazoan monoamine transporters we identified representatives in the major branches of metazoan evolution by polymerase chain reaction (PCR)-amplifying conserved cDNA fragments from isolated nervous tissue and by analyzing available genomic data. Analysis of conserved motifs in the sequence data suggest that the presumed common ancestor of modern-day Bilateria expressed at least three functionally distinct monoamine transporters in its nervous system: a SERT currently found throughout bilaterian phyla, a DAT now restricted in distribution to protostome invertebrates and echinoderms and a third monoamine transporter (MAT), widely represented in contemporary Bilateria, that is selective for catecholamines and/or phenolamines. Chordate DATs, NETs, epinephrine transporters (ETs) and arthropod and annelid OATs all belong to the MAT clade. Contemporary invertebrate and chordate DATs belong to different SLC6 clades. Furthermore, the genes for dopamine and norepinephrine transporters of vertebrates are paralogous, apparently having arisen through duplication of an invertebrate MAT gene after the loss of an invertebrate-type DAT gene in a basal protochordate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».