Multiscale population genetic analysis of mule deer (Odocoileus hemionus hemionus) in western Canada sheds new light on the spread of chronic wasting disease
Notice bibliographique
Résumé
To successfully manage wildlife diseases, it is necessary to understand factors that influence spread. One approach is to analyze host movement and social structure, as these behaviors can be associated with the probability of transmission. Some populations of mule deer ( Odocoileus hemionus hemionus (Rafinesque, 1817)) in western Canada are infected with chronic wasting disease (CWD), a transmissible and fatal neurodegenerative disease. We used population analysis of spatial genetic structure of mule deer at broad and local scales to understand factors that influence spread. We genotyped 2535 mule deer sampled from Alberta, Saskatchewan, and portions of British Columbia using 16 microsatellite loci. We found weak genetic structure at broad spatial scales (overall FST = 0.008) that was well defined by geographic distance, indicating the risk of CWD spread from the focus of infection will decline gradually with increasing distance, but there are no barriers to the spread over time. At the local scale of approximately 2 km, elevated relatedness among CWD-infected individuals suggests transmission rates within social groups. Sex-biased spatial autocorrelation in genetic relatedness also indicates that female philopatry underlies the social structure, and therefore transmission among relatives is potentially driving local disease persistence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».