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Enregistrement W2159358696 · doi:10.1007/s00335-012-9422-2

The mammalian gene function resource: the international knockout mouse consortium

2012· article· en· W2159358696 sur OpenAlexafffund
Allan Bradley, Konstantinos Anastassiadis, A. Ayadi, James F. Battey, Cindy Bell, Marie‐Christine Birling, Joanna Bottomley, Steve D. M. Brown, Antje Bürger, Carol J. Bult, Wendy Bushell, Francis S. Collins, Christian Desaintes, Brendan Doe, Aris N. Economides, Janan T. Eppig, Richard H. Finnell, Colin Fletcher, Martin Fray, David Frendewey, Roland H. Friedel, Frank Grosveld, Jens Hansen, Yann Hérault, Geoffrey G. Hicks, Andreas Hörlein, Richard Houghton, Martin Hrabě de Angelis, Danny Huylebroeck, Vivek Iyer, Pieter J. de Jong, James A. Kadin, Cornelia Kaloff, Karen L. Kennedy, Manousos Koutsourakis, K. C. Kent Lloyd, Susan Marschall, Jeremy Mason, Colin McKerlie, Michael P. McLeod, Harald von Melchner, Mark W. Moore, Alejandro O. Mujica, András Nagy, Mikhail Nefedov, Lauryl M. J. Nutter, Guillaume Pavlovic, Jane L. Peterson, Jonathan D. Pollock, Ramiro Ramírez‐Solis, Derrick E. Rancourt, Marcello Raspa, Jacques Remacle, Martin Ringwald, Barry P. Rosen, Nadia Rosenthal, Janet Rossant, Patricia Ruíz, Edward J. Ryder, Joel Schick, Frank Schnütgen, Paul N. Schofield, Claudia Seisenberger, Mohammed Selloum, Elizabeth M. Simpson, William C. Skarnes, Damian Smedley, William L. Stanford, A. Francis Stewart, Kevin Stone, Kate Swan, Hamsa D. Tadepally, Lydia Teboul, Glauco P. Tocchini‐Valentini, David M. Valenzuela, Anthony P. West, Ken‐ichi Yamamura, Yuko Yoshinaga, Wolfgang Wurst

Notice bibliographique

RevueMammalian Genome · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalSickKids FoundationOttawa HospitalUniversity of ManitobaGenome Canada
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Human Genome Research InstituteNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthEuropean CommissionGenome Canada
Mots-clésBiologyGeneGene knockoutGenomeGeneticsConditional gene knockoutMutantComputational biologyGene targetingKnockout mouseEmbryonic stem cellPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2007, the International Knockout Mouse Consortium (IKMC) made the ambitious promise to generate mutations in virtually every protein-coding gene of the mouse genome in a concerted worldwide action. Now, 5 years later, the IKMC members have developed high-throughput gene trapping and, in particular, gene-targeting pipelines and generated more than 17,400 mutant murine embryonic stem (ES) cell clones and more than 1,700 mutant mouse strains, most of them conditional. A common IKMC web portal (www.knockoutmouse.org) has been established, allowing easy access to this unparalleled biological resource. The IKMC materials considerably enhance functional gene annotation of the mammalian genome and will have a major impact on future biomedical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,138

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0410,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations328
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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