MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2159380758 · doi:10.1080/08916930902911720

Low agreement between radio binding assays in analyzing glutamic acid decarboxylase (GAD65Ab) autoantibodies in patients classified with type 2 diabetes

2009· article· en· W2159380758 sur OpenAlexfundno aff
Bledar Daka, Maria Svensson, Åke Lernmark, Lucia Mincheva‐Nilsson, Göran Hallmans, Olov Rolandsson

Notice bibliographique

RevueAutoimmunity · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre for Blood Research, University of British ColumbiaLunds Universitet
Mots-clésConcordanceGlutamate decarboxylaseAutoantibodyDiabetes mellitusMedicineInternal medicineType 1 diabetesImmunologyBiologyEndocrinologyAntibodyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autoantibodies against glutamic acid decarboxylase (GAD65Ab) are used in the classification of diabetes in adults. We assessed the concordance in GAD65 autoantibody levels within subjects between three different GAD65Ab radio binding assays (RBA). Plasma samples from 112 diabetes patients (median age 50 years) initially classified with type 2 diabetes was randomly selected from a local diabetes registry. Coded samples were analyzed with two RBA employing (35)S-labeled GAD65. The first used the pEx9 plasmid (pEx9 RBA), the second employed the pThGAD65 plasmid (pThGAD65 RBA) to label GAD65 by in vitro transcription translation. We also used a commercial kit employing plasmid pGAD17 labelled with (125)I (pGAD17 RBA). Subsequent analyses followed standard procedures. Two different cut-offs for GAD65Ab positivity were used in all three assays. We calculated the correlation, concordance, and agreement between the assays. The proportion of GAD65Ab positivity differed between assays when low cut-offs were used (pEx9 RBA 25%, pThGAD65 RBA 17.9%, and pGAD17 RBA 12.5%, respectively). When high cut-offs were applied, the concordance between the pEx9 RBA and the pThGAD65 RBA was 97.3 while their concordance to the pGAD17 RBA was lower (88.4 and 87.4, respectively). There was a low agreement between both pEx9 RBA and pGAD17 RBA (0.45, 95% CI 0.20-0.70) and between pThGAD65 RBA and pGAD17 RBA (0.43, 95% CI 0.18-0.68). We found discrepancies in determining the GAD65Ab positivity, which constitutes a problem when GAD65Ab are used clinically. Further methodological GAD65Ab assays studies are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,905

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAutoimmunityMême sujetDiabetes and associated disordersTravaux en français237 207