MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2159393320 · doi:10.1085/jgp.200910351

Mechanistic basis for LQT1 caused by S3 mutations in the KCNQ1 subunit of <i>IKs</i>

2010· article· en· W2159393320 sur OpenAlexafffund
Jodene Eldstrom, Hongjian Xu, Daniel Werry, CongBao Kang, Matthew E. Loewen, Amanda Degenhardt, Shubhayan Sanatani, Glen F. Tibbits, Charles R. Sanders, David Fedida

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersHeart and Stroke Foundation of British Columbia and YukonHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésMutantGatingChemistryLong QT syndromeMutationWild typeProtein subunitBiophysicsTransmembrane domainPotassium channelIon channelMolecular biologyCell biologyBiologyBiochemistryQT intervalGeneInternal medicineReceptorMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Long QT interval syndrome (LQTS) type 1 (LQT1) has been reported to arise from mutations in the S3 domain of KCNQ1, but none of the seven S3 mutations in the literature have been characterized with respect to trafficking or biophysical deficiencies. Surface channel expression was studied using a proteinase K assay for KCNQ1 D202H/N, I204F/M, V205M, S209F, and V215M coexpressed with KCNE1 in mammalian cells. In each case, the majority of synthesized channel was found at the surface, but mutant I(Ks) current density at +100 mV was reduced significantly for S209F, which showed approximately 75% reduction over wild type (WT). All mutants except S209F showed positively shifted V(1/2)'s of activation and slowed channel activation compared with WT (V(1/2) = +17.7 +/- 2.4 mV and tau(activation) of 729 ms at +20 mV; n = 18). Deactivation was also accelerated in all mutants versus WT (126 +/- 8 ms at -50 mV; n = 27), and these changes led to marked loss of repolarizing currents during action potential clamps at 2 and 4 Hz, except again S209F. KCNQ1 models localize these naturally occurring S3 mutants to the surface of the helices facing the other voltage sensor transmembrane domains and highlight inter-residue interactions involved in activation gating. V207M, currently classified as a polymorphism and facing lipid in the model, was indistinguishable from WT I(Ks). We conclude that S3 mutants of KCNQ1 cause LQTS predominantly through biophysical effects on the gating of I(Ks), but some mutants also show protein stability/trafficking defects, which explains why the kinetic gain-of-function mutation S209F causes LQT1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,183
Score d'incertitude au seuil0,223

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of General PhysiologyMême sujetCardiac electrophysiology and arrhythmiasTravaux en français237 207