MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2159403112 · doi:10.1016/j.jala.2005.04.007

Design and Automated Control of the Electron Microscopy Proteomic Organellar Preparation Robot

2005· article· en· W2159403112 sur OpenAlexaff
Raymond G. Waterbury, Karishma Punwani, John Bergeron, Robert E. Kearney

Notice bibliographique

RevueJALA Journal of the Association for Laboratory Automation · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésModular designThroughputComputer scienceRobotInstrument controlSample preparationComputer hardwareArtificial intelligenceChemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Electron Microscopy Proteomic Organellar Preparation (EMPOP) robot is a tool for high-throughput preparation of subcellular fraction samples for electron microscopic identification. It provides a means of validating subcellular sample purity and confirming protein localization needed for organellar proteomics. The device handles all chemical and mechanical manipulations required to prepare organelles for electron microscopic examination. It has a modular, integrated design that supports automated filtration, chemical processing, delivery, and embedding of up to 96 subcellular fraction samples in parallel. Subcellular fraction specimens are extremely fragile. Consequently, the system was designed as a single unit to minimize mechanical stress on the samples by integrating a core mechanism, composed of four modular plates, and five support subsystems: (1) a cooling platform, (2) an automated fluid handling subsystem, (3) an electromagnetic arm, (4) a plate transfer platform, and (5) a 5-axis motion control system (X, Y, Z, θ, ø). System control is fully automated to provide standardized, reproducible subcellular fraction sample processing while maintaining flexibility for adjustment and recall of instrumentation and process operational parameters. To achieve this, the control software was built on two coordinated levels: (1) a user interface for system testing, calibration, setup, and process monitoring and (2) low-level real-time control routines. The EMPOP robot provides, for the first time, massive, parallel electron microscopic screening and quantitative analysis of subcellular and protein targets necessary for high-throughput proteomics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,293

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJALA Journal of the Association for Laboratory AutomationMême sujetAdvanced Proteomics Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207