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Enregistrement W2159419020 · doi:10.1074/jbc.m212745200

Inhibition of Human SERCA3 by PL/IM430

2003· article· en· W2159419020 sur OpenAlexaff
Charukeshi P. Chandrasekera, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryATP hydrolysisMonoclonal antibodyHydrolysisAmino acidBiochemistryEpitopeProteolysisBiophysicsEnzymeAntibodyATPaseBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The monoclonal antibody PL/IM430 has previously been reported to uncouple Ca(2+) transport from ATP hydrolysis in platelet membranes (Hack, N., Wilkinson, J. M., and Crawford, N. (1988) Biochem. J. 250, 355-361). More recently, we have demonstrated that this antibody is specific for human SERCA3 (Poch, E., Leach, S., Snape, S., Cacic, T., MacLennan, D. H., and Lytton, J. (1998) Am. J. Physiol. 275, C1449-C1458). In this paper, we have extended the analysis of the PL/IM430-SERCA3 interaction. Using HEK293 cells to express human SERCA3a, we were able to measure both ATP-mediated, oxalate-dependent (45)Ca(2+) uptake and Ca(2+)-dependent ATP hydrolysis activities due exclusively to SERCA3. Treatment with PL/IM430 inhibited both activities almost identically, with a maximal inhibition of 81 and 73% and a half-maximal concentration of 8.3 and 5.9 microg/ml, for Ca(2+) uptake and ATP hydrolysis, respectively. We conclude that PL/IM430 does inhibit SERCA3 activity but does not uncouple Ca(2+) transport from ATP hydrolysis. Using a combination of partial proteolysis, GST fusion protein expression, and mutation of residues that differ between rat and human SERCA3, we have identified human SERCA3 amino acids Pro(8) and Glu(192) as essential to forming the PL/IM430 epitope. PL/IM430 thus recognizes a linearly noncontiguous set of amino acids within the actuator domain of human SERCA3. We propose that PL/IM430 inhibits SERCA3 activity by sterically preventing movement of the actuator domain into a catalytically critical position in the E2 conformation of the enzyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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