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Enregistrement W2159526013 · doi:10.1109/cne.2007.369758

Evaluation of approximate stochastic Hodgkin-Huxley models

2007· article· en· W2159526013 sur OpenAlexaff
Ian C. Bruce

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
Thématiquestochastic dynamics and bifurcation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHodgkin–Huxley modelGatingNoise (video)AlgorithmMarkov chainGaussian noiseChannel (broadcasting)Markov processGaussianComputer scienceMathematicsStatistical physicsApplied mathematicsStatisticsPhysicsArtificial intelligenceTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fox and colleagues (Fox, 1997; Fox ang Lu, 1994) derived an algorithm based on stochastic differential equations for approximating the kinetics of ion channel gating that is substantially simpler and faster than "exact" algorithms for simulating Markov process models of channel gating. However, Mino and colleagues (2002) argued that the approximation may not be sufficiently accurate in describing the statistics of action potential generation. Bruce (2007) subsequently showed that some of the inaccuracies described by Mino et al. (2002 were due to implementation choices, but several important inaccuracies remained. The objective of this study was to develop a framework for analyzing the remaining inaccuracies and determining their origin. Simulations of a patch of membrane with voltage-gated sodium and potassium channels were performed using an exact algorithm for the kinetics of channel gating and the approximate algorithm of Fox. The Fox algorithm assumes that channel gating particle dynamics have a stochastic term that is uncorrelated, zero-mean Gaussian noise, whereas the simulation results of this study demonstrate that in many cases the stochastic term in the Fox algorithm should be correlated and non-Gaussian noise with a non-zero mean. The results indicate that the source of these differences in noise statistics is that the Fox algorithm does not adequately describe the combined behavior of the multiple activation particles in each sodium and potassium channel (three and four, respectively)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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