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Enregistrement W2159548736 · doi:10.1111/j.0105-2896.2005.00236.x

Studies of patients' thymi aid in the discovery and characterization of immunodeficiency in humans

2005· review· en· W2159548736 sur OpenAlexaff
Chaim M. Roifman

Notice bibliographique

RevueImmunological Reviews · 2005
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrimary immunodeficiencyImmunodeficiencyBiologyImmune systemGenotypingImmunologyComputational biologyTransplantationSevere combined immunodeficiencyBioinformaticsGeneGeneticsMedicineGenotypeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studying the molecular and genetic bases of primary immunodeficiency is valuable at several levels. First, such information directly benefits patients in both short- and long-term management. Sophisticated diagnostic tools based on these studies can be used early and lead to appropriate treatment before potentially fatal infections and complications arise. Genotyping is also critical for future development and implementation of gene therapy. Secondly, investigating primary immunodeficiency helps understand the normal immune system in humans. As described in this report, the roles of zeta-associated protein of 70 kDa (Zap-70), CD25, and CD3delta are substantially different in humans when compared with the roles of homologous molecules in other species. Last, information obtained from these studies can be applied to other fields of investigation. Prominent examples for such applications include the intensive effort to design and produce specific inhibitors of Zap-70 and Janus kinase 3 as specific immunosuppressive agents. Most types of primary immunodeficiency in general and severe combined immunodeficiency in particular are rare and therefore cannot be easily studied by using traditional genetic methodology. Instead, biochemical methods were used to explore for candidate genes as was the case in the discovery of Zap-70 deficiency. Critical to the success of these discoveries was the careful analysis of patients' thymus glands. Detection of abnormalities in the thymus in these patients, which preceded identification of the genetic defect, aided in the assessment of the severity and nature of the immune disorder (primary versus secondary). Such assessment is critical before high-risk bone marrow transplantation. Equally important was the contribution of studies of the thymus to the description of novel phenotype of immunodeficiency as clearly demonstrated in defining CD8 lymphocytopenia, Zap-70 deficiency, and CD25 deficiency. Indeed, analysis of the thymus directly pointed to CD25 as candidate gene. Recently, the study of thymocyte-derived transcripts using DNA microarrays was key to discovering CD3delta deficiency. Finally, immunohistochemical analysis of the thymus was critical in pinpointing the roles of Zap-70, CD25, and CD3delta in the development of human T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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