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Enregistrement W2159594136 · doi:10.1139/o07-151

NRF-1 is the major transcription factor regulating the expression of the human <i>TOMM34</i> gene

2008· article· en· W2159594136 sur OpenAlexvenueno aff
Rafael Blesa, Jesús A. Prieto-Ruiz, Beth A. Abraham, Bridget L. Harrison, Anita Hegde, José Hernández-Yago

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factorBiologyChromatin immunoprecipitationCell biologyPromoterGene expressionGeneRegulation of gene expressionMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human TOMM34 gene encodes a cytosolic protein with chaperone-like activity that helps import some preproteins to the mitochondria by keeping them in an unfolded, import-compatible state. TOMM34 was found to be upregulated frequently in colorectal tumors, suggesting that it also has a role in the growth of cancer cells. In this context, TOMM34 is a potential target for novel anticancer drugs, and it might also be used in the diagnosis of colorectal cancer. Nuclear respiratory factors (NRFs) play an important role in governing the nuclear-mitochondrial interactions implicated in mitochondrial biogenesis. Our previous studies revealed that NRFs promote the expression of the major members of the mitochondrial transport machinery, TOMM70 and TOMM20. Here we report the existence of binding sites for NRF-1, Sp1, and NRF-2 in the 5' region of the human TOMM34 gene. We determined the effects of mutations at these sites on promoter activity in HeLa S3 and A204 cells, in conjunction with chromatin immunoprecipitation experiments, electrophoretic mobility shift assays, and in vivo methylation analysis of the promoter region. We conclude that NRF-1 is the main transcription factor regulating the expression of TOMM34. Sp1 interacts with NRF-1 to stimulate the promoter's full activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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