Characterization of clonal strains of<i>Pseudomonas aeruginosa</i>isolated from cystic fibrosis patients in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that can form biofilms in the lungs and airways of cystic fibrosis (CF) patients, resulting in chronic endobronchial infection. Two clonal strains of P. aeruginosa, named type A and type B, have recently been identified and have been found to infect more than 20% of CF patients in Ontario, Canada. In this study, 4 type A and 4 type B isolates retrieved from 8 CF patients in Ontario, Canada, were characterized. All 8 isolates grew well in rich medium and formed biofilms in vitro. Antibiotic resistance profiles of bacteria grown in biofilms and planktonic culture were studied via minimal bactericidal concentration assays for tobramycin, gentamicin, and ciprofloxacin. Compared to laboratory strains of P. aeruginosa, all 8 isolates showed increased resistance to all antibiotics studied in both biofilm and planktonic assays. Gene expression analysis of mexX, representing the MexXY-OprM efflux pump, and mexA, representing MexAB-OprM, revealed that these genes were up-regulated in the 8 clinical isolates. These results suggest clonal type A and type B isolates of P. aeruginosa isolated from CF patients in Ontario, Canada, show a multidrug resistance pattern that can be partially explained as being due to the increased expression of common antibiotic efflux systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».