Microarray Analysis of Metastasis-Associated Gene Expression Profiling in a Murine Model of Thyroid Carcinoma Pulmonary Metastasis: Identification of S100A4 (Mts1) Gene Overexpression as a Poor Prognostic Marker for Thyroid Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Tumor cell invasion and metastasis are the hallmark of malignant neoplasm. Despite advances in the management of thyroid carcinoma and other solid tumors, metastasis continues to be the most significant cause in cancer mortality. To gain new insights into this complex process in thyroid carcinoma, we established a thyroid carcinoma cell line (ARO-met2) with high metastatic capacity to the lung by sequential passage of a human anaplastic thyroid cancer cell line (ARO) through the lung of a nude mouse. Global patterns of gene expression were analyzed in cells of the parental ARO and the ARO-met2, using Atlas human cancer 1.2 array with 1176 cancer-related genes. In total, 184 genes were differentially expressed more than 1.5 times, and 64 genes were differentially expressed over two times. Among those 64 genes, 43 were overexpressed, and 21 genes were underexpressed. Many genes whose increased expression was thought to be related to tumor progression were identified, such as c-Met, ezrin, integrin, motility-related protein-1, cadherin, and S100A4. The most highly expressed gene is the S100A4 (8-fold higher than control), which is a member of a small calcium binding protein family and is involved in the cell proliferation and cancer progression. The S100A4 overexpression in the ARO-met2 cells was later confirmed by Northern blot and real-time reverse transcriptase-PCR. Analysis of 49 thyroid tumor specimens by real-time reverse transcriptase-PCR (eight benign goiters, 36 papillary, and five anaplastic carcinomas) revealed that S100A4 overexpression was present in most advanced thyroid carcinomas and lymph node metastases, and was associated with poor prognosis. None of the benign goiters was found to have S100A4 overexpression. These data suggest that S100A4 could be used as a prognostic marker for thyroid carcinoma. Given that S100A4 is involved in tumor progression and metastasis, it may be a potential target for therapeutic intervention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».