Transient T Cell Receptor β‐Chain Variable Region–Specific Expansions of CD4<sup>+</sup>and CD8<sup>+</sup>T Cells during the Early Phase of Pediatric Human Immunodeficiency Virus Infection: Characterization of Expanded Cell Populations by T Cell Receptor Phenotyping
Notice bibliographique
Résumé
T cell receptor (TCR) repertoire perturbations are commonly detected in CD8+ T cells during adult primary human immunodeficiency virus (HIV) infection and have been associated with HIV-specific cytotoxic T cell responses. By use of flow cytometry, transient high-level TCR beta-chain variable region-specific expansions of CD4+ and CD8+ T cells were observed more frequently in HIV-infected children than in children exposed to HIV who remained uninfected. TCR beta-chain diversity analysis and diversity-specific polymerase chain reaction were used to study the clonality of expanded CD4+ and CD8+ subsets. In CD8+ T cells, structural features of the complement-determining regions 3 were altered during the course of the expansion, and persistent TCR clonotypes were observed, consistent with antigen-driven selection. In contrast, TCR beta-chain variable region-specific expansions without clonotypic overrepresentation or persistence were observed in CD4+ T cells, possibly related to HIV-specific helper T cell responses or to the progressive destruction of the CD4+ cell compartment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».