Hairpins involving both inverted and direct repeats are associated with homoplasious indels in non-coding chloroplast DNA of<i>Taraxacum</i>(Lactuceae: Asteraceae)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Sequence variation in 2.2 kb of non-coding regions of the chloroplast genome of eight dandelions (Taraxacum: Lactuceae) from Asia and Europe is interpreted in the light of the phylogenetic signal of base substitutions vs. indels (insertions-deletions). The four non-coding regions displayed a total of approximately 30 structural mutations of which 9 are potentially phylogenetically informative. Insertions, deletions, and an inversion were found that involved consecutive stretches of up to 172 bases. When compared to phylogenetic relationships of the chloroplast genomes based on nucleotide substitutions only, many homoplasious indels (33%) were detected that differed considerably in length and did not comprise simple sequence repeats typically associated with replication slippage. Though many indels in the intergenic spacers were associated with direct repeats, frequently, the variable stretches participated in inverted repeat stabilized hairpins. In each intergenic spacer or intron examined, nucleotide stretches ranging from 30 to 60 bp were able to fold into stabilized secondary structures. When these indels were homoplasious, they always ranked among the most stabilized hairpins in the non-coding regions. The association of higher order structures that involve both classes of repeats and parallel structural mutations in hot spot regions of the chloroplast genome can be used to differentiate among mutations that differ in phylogenetic reliability.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle