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Enregistrement W2159785760 · doi:10.1104/pp.106.090811

Characterization of a Plastid Triacylglycerol Lipase from Arabidopsis

2007· article· en· W2159785760 sur OpenAlexaff
Anita K. Padham, Marianne T Hopkins, Tzann‐Wei Wang, Linda McNamara, Maisie Lo, Lynn G.L. Richardson, Matthew D. Smith, Catherine A. Taylor, John E. Thompson

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArabidopsisBiologyLipaseChloroplastArabidopsis thalianaBiochemistrySiliquePlastidComplementary DNAGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Full-length cDNA corresponding to Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) gene At2g31690, which has been annotated in GenBank as a putative triacylglycerol (TAG) lipase, was obtained by reverse transcription-polymerase chain reaction using RNA from senescing rosette leaves of Arabidopsis as a template. The cognate protein was found to contain the lipase active site sequence, and corresponding recombinant protein proved capable of deesterifying TAG. In vitro chloroplast import assays indicated that the lipase is targeted to chloroplasts. This was confirmed by confocal microscopy of rosette leaf tissue treated with fluorescein isocyanate-labeled, lipase-specific antibody, which revealed that lipase protein colocalizes with plastoglobular neutral lipids. Western-blot analysis indicated that the lipase is expressed in roots, inflorescence stems, flowers, siliques, and leaves and that it is strongly up-regulated in senescing rosette leaf tissue. Transgenic plants with suppressed lipase protein levels were obtained by expressing At2g31690 cDNA in antisense orientation under the regulation of a constitutive promoter. Transgenic plants bolted and flowered at the same time as wild-type plants, but were severely stunted and exhibited delayed rosette senescence. Moreover, the stunted growth phenotype correlated with irregular chloroplast morphology. The chloroplasts of transgenic plants were structurally deformed, had reduced abundance of thylakoids that were abnormally stacked, and contained more plastoglobular neutral lipids than chloroplasts of wild-type plants. These observations collectively indicate that this TAG lipase plays a role in maintaining the structural integrity of chloroplasts, possibly by mobilizing the fatty acids of plastoglobular TAG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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