Genetic variability of Canadian elite cultivars of summer turnip rape (<i>Brassica rapa</i> L.) revealed by simple sequence repeat markers
Notice bibliographique
Résumé
Canadian public oilseed breeding programs have played a leading role in the development of canola-quality Brassica rapa oilseed cultivars, but the genetic variability of the cultivars developed over the past 60 yr is poorly understood. Simple sequence repeat (SSR) markers were applied to assess the genetic variability of 294 plants representing one landrace introduced from Poland ca. 1940 and nine Canadian elite B. rapa cultivars released by Agriculture and Agri-Food Canada since 1964. Application of 18 SSR primer pairs detected 27 likely loci on five or more linkage groups and 123 polymorphic alleles. The allelic frequencies ranged from 0.003 to 0.997 and averaged 0.262. The estimates of mean heterozygosity for these cultivars ranged from 0.126 to 0.197 and averaged 0.165. Significant decreases of SSR alleles and average dissimilarities were observed over the 60 yr of breeding effort. The proportion of total SSR variation residing among the cultivars was 10.4%; between high vs. low erucic acid cultivars 5% and between high- vs. low-glucosinate cultivars 5%. Pairwise genetic differentiation ranged from 0.025 to 0.184 and averaged 0.104. Genetic clustering of these cultivars revealed AC Sunbeam to be a genetically unique cultivar, and two distinct groups of the other nine cultivars were separated by high- vs. low-glucosinate content. Several distinct genotypes, largely derived from the landrace Polish, were identified. These findings are useful for broadening the genetic base of elite B. rapa germplasm, selecting genetically diverse genotypes for synthetic and hybrid combinations, and conserving this germplasm.Key words: Simple sequence repeat, turnip rape (summer), Brassica rapa, genetic diversity, genetic relationship, genetic structure
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».