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Enregistrement W2159844839 · doi:10.1128/jvi.02021-09

Different Potential of C-Type Lectin-Mediated Entry between Marburg Virus Strains

2010· article· en· W2159844839 sur OpenAlexaff
Keita Matsuno, Noriko Kishida, Katsuaki Usami, Manabu Igarashi, Reiko Yoshida, Eri Nakayama, Masayuki Shimojima, Heinz Feldmann, Tatsuro Irimura, Yoshihiro Kawaoka, Ayato Takada

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLectinC-type lectinVesicular stomatitis virusViral entryVirologyVirusGlycoproteinMolecular biologyViral replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The glycoproteins (GPs) of filoviruses are responsible for virus entry into cells. It is known that GP interacts with cellular C-type lectins for virus attachment to cells. Since primary target cells of filoviruses express C-type lectins, C-type lectin-mediated entry is thought to be a possible determinant of virus tropism and pathogenesis. We compared the efficiency of C-type lectin-mediated entry between Marburg virus strains Angola and Musoke by using a vesicular stomatitis virus (VSV) pseudotype system. VSV pseudotyped with Angola GP (VSV-Angola) infected K562 cells expressing the C-type lectin, human macrophage galactose-type C-type lectin (hMGL), or dendritic cell-specific ICAM-3-grabbing nonintegrin (DC-SIGN) more efficiently than VSV pseudotyped with Musoke GP (VSV-Musoke). Unexpectedly, the binding affinity of the C-type lectins to the carbohydrates on GPs did not correlate with the different efficiency of C-type lectin-mediated entry. Site-directed mutagenesis identified the amino acid at position 547, which switched the efficiency of C-type lectin-mediated entry. In a three-dimensional model of GP, this amino acid was in close proximity to the putative site of cathepsin processing. Interestingly, the cathepsin inhibitors reduced the infectivity of VSV-Angola less efficiently than that of VSV-Musoke in C-type lectin-expressing K562 cells, whereas only a limited difference was found in control cells. The amino acid at position 547 was critical for the different effects of the inhibitors on the virus infectivities. These results suggest that the efficiency of C-type lectin-mediated entry of filoviruses is controlled not only by binding affinity between C-type lectins and GP but also by mechanisms underlying endosomal entry, such as proteolytic processing by the cathepsins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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