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Enregistrement W2159889484 · doi:10.1158/1055-9965.epi-13-0671

Single-Nucleotide Polymorphisms in Reductase Genes Are not Associated with Response to Daunorubicin-Based Remission Induction

2013· article· en· W2159889484 sur OpenAlexafffund
Joanna M. Lubieniecka, Jie Liu, Jinko Graham, Daniel J. Heffner, Ronald E. Reid, Donna E. Hogge, T A Grigliatti, Wayne Riggs

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDaunorubicinSingle-nucleotide polymorphismGeneMedicineGeneticsReductaseBiologyGenotypeEnzymeChemotherapyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To improve the quality of care for patients with acute myeloid leukemia (AML), biomarkers predictive of response to the standard daunorubicin-based induction therapy are needed. Genetic variants affecting daunorubicin metabolism are attractive candidates for such biomarkers. METHODS: We have previously shown that 13 of the naturally occurring nonsynonymous single-nucleotide polymorphisms (SNP) in the reductase genes affect daunorubicin metabolism in vitro. Here, we test these SNPs individually and jointly for association with response to one cycle of daunorubicin-based chemotherapy in a sample of 189 patients with acute myelogenous leukemia. RESULTS: Of the 13 SNPs included in this study, only 5 passed quality control filters. No association was found between these 5 SNPs and response to one cycle of daunorubicin-based induction therapy in either individual or joint effect tests. CONCLUSIONS: Despite their showing in vitro effect on metabolic rate of daunorubicin, the nonsynonymous SNPs in the reductase genes on their own are not significant contributors to the observed variability in response to daunorubicin therapy and thus, as singularities, are not useful biomarkers of this outcome. IMPACT: The results of this investigation provide important information for studies on personalization of anthracycline-based therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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