MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2159985092 · doi:10.1002/ajmg.a.34216

Microdeletion 9q22.3 syndrome includes metopic craniosynostosis, hydrocephalus, macrosomia, and developmental delay

2011· article· en· W2159985092 sur OpenAlexaff
Eric Muller, Swaroop Aradhya, Joan Atkin, Erin P. Carmany, Alison M. Elliott, Albert E. Chudley, Robin D. Clark, David B. Everman, Shannon Garner, Bryan D. Hall, Gail E. Herman, Emma Kivuva, Subhadra Ramanathan, David A. Stevenson, David W. Stockton, Louanne Hudgins

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCraniosynostosisPTCH1HaploinsufficiencyLocus (genetics)HydrocephalusGeneticsBiologyCopy-number variationMedicineGeneSurgeryPhenotypeGenomeSonic hedgehog

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Basal cell nevus syndrome (BCNS), also known as Gorlin syndrome (OMIM #109400) is a well-described rare autosomal dominant condition due to haploinsufficiency of PTCH1. With the availability of comparative genomic hybridization arrays, increasing numbers of individuals with microdeletions involving this locus are being identified. We present 10 previously unreported individuals with 9q22.3 deletions that include PTCH1. While 7 of the 10 patients (7 females, 3 males) did not meet strict clinical criteria for BCNS at the time of molecular diagnosis, almost all of the patients were too young to exhibit many of the diagnostic features. A number of the patients exhibited metopic craniosynostosis, severe obstructive hydrocephalus, and macrosomia, which are not typically observed in BCNS. All individuals older than a few months of age also had developmental delays and/or intellectual disability. Only facial features typical of BCNS, except in those with prominent midforeheads secondary to metopic craniosynostosis, were shared among the 10 patients. The deletions in these individuals ranged from 352 kb to 20.5 Mb in size, the largest spanning 9q21.33 through 9q31.2. There was significant overlap of the deleted segments among most of the patients. The smallest common regions shared among the deletions were identified in order to localize putative candidate genes that are potentially responsible for each of the non-BCNS features. These were a 929 kb region for metopic craniosynostosis, a 1.08 Mb region for obstructive hydrocephalus, and a 1.84 Mb region for macrosomia. Additional studies are needed to further characterize the candidate genes within these regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Medical Genetics Part AMême sujetHedgehog Signaling Pathway StudiesTravaux en français237 207