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Enregistrement W2160062138 · doi:10.6000/2292-2598.2015.03.03.2

Somatic Mosaicism as Modulator of the Global and Intellectual Phenotype in Epimutated Angelman Syndrome Patients

2015· article· en· W2160062138 sur OpenAlexvenueno aff
Silvia Russo, Ester Mainini, Chiara Luoni, Francesca Cogliati, Valentina Giorgini, Maria Teresa Bonati, Francesca Forzano, Cristiano Termine, Alessandra Murgia, Mara Patrini, Antonella Fabretto, Skabar Aldo, Elena Freri, Vanna Pecile, Lidia Larizza

Notice bibliographique

RevueJournal of Intellectual Disability - Diagnosis and Treatment · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesIstituto Auxologico Italiano
Mots-clésAngelman syndromeUBE3AGenomic imprintingGeneticsUniparental disomyImprinting (psychology)BiologyAlleleIntellectual disabilityChromosome 15Multiplex ligation-dependent probe amplificationNeurodevelopmental disorderDNA methylationChromosomeGeneUbiquitin ligaseKaryotypeExonGene expressionUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Angelman Syndrome (AS) is due to the loss of function of the single UBE3A gene, mapping to chromosome 15q11-q13 and encoding the E6AP ubiquitin ligase. Expression of UBE3A is subject to genomic imprinting which is restricted to the brain, where only the maternal allele is transcribed. AS pathogenetic mechanisms include deletion of the maternal 15q11-13 chromosomal region, chromosome 15 paternal uniparental disomy (UPD), Imprinting Defects (ImpD) leading to silencing of the maternal allele and intragenic mutations of the maternal UBE3A allele. From our AS cohort we sorted out for detailed clinical-molecular characterization six mosaic cases, five with ImpD epimutations and one with patUPD15. This latter case referred for intellectual disability and fortuitously solved by SNP array, is, to our knowledge, the unique patient reported with mosaic patUPD of this imprinted region. Somatic epimutation mosaicism represents a challenge for both clinical and molecular diagnostics. The described patients, referred to our center either for uncertain AS or simply for intellectual disability, could be molecularly characterized by applying a multi-method approach including Methylation-Sensitive PCR and MS-MLPA without a strict cut off. The percentage of normal cells detected ranged up to 40%. We confirm the mild phenotype reported in mosaic AS ImpD and provide a detailed analysis of IQ. Mild mental retardation, with significant difficulties in language expression, but only mildly impaired performance skills, together with pathognomonic EEG, is a cue not to overlook in mosaic AS patients. Mosaic epimutations should be searched also in patients with minor AS features and presenting only with intellectual disability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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